У меня была эта проблема на Thinkpad X230 с Ubuntu 12.04, она всегда перезагружается после выключения при отключении. Я нашел решение, описанное здесь, для работы для меня:
Установить laptop-mode-tools (если он еще не установлен):
sudo apt-get install laptop-mode-tools
Открыть конфигурацию grub в /etc/default/grub в тексте редактор и добавьте (или измените) эту строку:
GRUB_CMDLINE_LINUX_DEFAULT="acpi=noirq quiet splash"
Обновите grub, используя следующую команду:
sudo update-grub