Для Gnome 2 должно быть достаточно:
sudo gconftool-2 --direct --config-source xml:readwrite:/etc/gconf/gconf.xml.defaults --type string --set /apps/nautilus/preferences/default_folder_viewer list_view
Другими возможными значениями являются icon_view и compact_view
Для Ubuntu 12.04 и аналогичного интерфейса на основе Unity , отредактируйте файл /usr/share/glib-2.0/schemas/org.gnome.nautilus.gschema.xml: найдите ключ default-folder-viewer и замените его значение тегом <default> на 'list-view'