Как предотвратить единичную тире от управления клавиатурой [дублировать]

Я бы предложил использовать цикл while ... do

while read -r d; do
  cp -R -- foo/ "$d"
done < destinations.txt

В качестве альтернативы, используя xargs

xargs -n1 -a destinations.txt cp -R foo --