Отключить приостановку при нажатии fn + F4

Это нормальное поведение, не нужно беспокоиться. По какой-то причине очень сложно найти документацию об изменениях от apt-get до apt, но во время цикла выпуска 16.04 (или, возможно, в более ранней версии, 15.10) произошли изменения, чтобы переключиться на новый инструмент apt, который только обновляет источники, которые отличаются друг от друга, я думаю, что он использует контрольные суммы, чтобы увидеть, действительно ли файлы источников были изменены.