Любые рекомендации для менеджера загрузки в командной строке?

Используя gedit, отредактируйте файл grub.cfg, расположенный в /boot/grub.

Удалите тот, который не работает. Например, есть две записи, расположенные на разных разделах /dev/sda3 и /dev/sda4.

Затем нажмите save и voila.

### BEGIN /etc/grub.d/30_os-prober ###
menuentry 'Windows 7 (loader) (on /dev/sda4)' --class windows --class os $menuentry_id_option 'osprober-chain-BABCA4EEBCA4A67B' {
    insmod part_msdos
    insmod ntfs
    set root='hd0,msdos4'
    if [ x$feature_platform_search_hint = xy ]; then
      search --no-floppy --fs-uuid --set=root --hint-bios=hd0,msdos4 --hint-efi=hd0,msdos4 --hint-baremetal=ahci0,msdos4  BABCA4EEBCA4A67B
    else
      search --no-floppy --fs-uuid --set=root BABCA4EEBCA4A67B
    fi
    chainloader +1
}
menuentry 'Windows 7 (loader) (on /dev/sda3)' --class windows --class os $menuentry_id_option 'osprober-chain-BABCA4EEBCA4A67B' {
    insmod part_msdos
    insmod ntfs
    set root='hd0,msdos4'
    if [ x$feature_platform_search_hint = xy ]; then
      search --no-floppy --fs-uuid --set=root --hint-bios=hd0,msdos4 --hint-efi=hd0,msdos4 --hint-baremetal=ahci0,msdos4  BABCA4EEBCA4A67B
    else
      search --no-floppy --fs-uuid --set=root BABCA4EEBCA4A67B
    fi
    chainloader +1
}
### END /etc/grub.d/30_os-prober ###

Удаляю /dev/sda3, после удаления это будет выглядеть так

### BEGIN /etc/grub.d/30_os-prober ###
menuentry 'Windows 7 (loader) (on /dev/sda4)' --class windows --class os $menuentry_id_option 'osprober-chain-BABCA4EEBCA4A67B' {
    insmod part_msdos
    insmod ntfs
    set root='hd0,msdos4'
    if [ x$feature_platform_search_hint = xy ]; then
      search --no-floppy --fs-uuid --set=root --hint-bios=hd0,msdos4 --hint-efi=hd0,msdos4 --hint-baremetal=ahci0,msdos4  BABCA4EEBCA4A67B
    else
      search --no-floppy --fs-uuid --set=root BABCA4EEBCA4A67B
    fi
    chainloader +1
}
### END /etc/grub.d/30_os-prober ###