Раздел NTFS становится доступен только для чтения после обновления системы?

Сначала откройте терминал, затем отметьте файл как исполняемый с помощью команды chmod.

Теперь вы можете выполнить файл в terminal.

./file-name.bin

Если появляется сообщение об ошибке, включающее в себя проблему, например «отказ в доступе», используйте sudo для запуска ее как root (admin). Будьте осторожны, sudo позволяет совершать критические изменения в вашей системе.

sudo ./file-name.bin

http://howtoubuntu.org/how-to-execute-a-run-or-bin-file-in-ubuntu