Почему многие функции в gnome-tweak-tool недоступны?

Это не должно происходить и кажется ошибкой в ​​virtualbox. Подумайте, написать отчет об ошибке. Если вы используете два дисплея, вы можете отключить один из них, что может стать первой помощью. Я предлагаю установить гостевые дополнения, они содержат видеодрайвер. Чтобы это сделать, переключитесь на консоль / tty0 вашего виртуального ubuntu. Доступ к нему возможен с помощью ключа хоста + F1. Обычно ключ хоста является правильным управляющим ключом.

Вставьте гостевые дополнения, используя меню виртуальных боксов. mount cd с

sudo mount /dev/cdrom /mnt

перейти к / mnt и показать содержимое

cd /mnt
ls

Установить гостевые дополнения с помощью

sudo sh ./VirtualBoxLinuxAdditions.run

EDIT: активировали ли вы 2d или 3D-ускорение в VirtualBox? Это экспериментальная функция и может вызвать некоторые странные ошибки.