Вы должны добавить их в список избранных программ. Чтобы прочитать текущий список:
~$ dconf read /com/canonical/unity/launcher/favorites
['application://nautilus.desktop', 'application://firefox.desktop', 'application://libreoffice-writer.desktop', 'application://unity-control-center.desktop', 'application://gnome-terminal.desktop', 'unity://running-apps', 'unity://expo-icon', 'unity://devices']
Чтобы записать новый список
dconf write /com/canonical/unity/launcher/favorites "['application://nautilus.desktop', 'application://firefox.desktop', 'application://libreoffice-writer.desktop', 'application://unity-control-center.desktop', 'application://gnome-terminal.desktop', 'unity://running-apps', 'unity://expo-icon', 'unity://devices']"
Невозможно прочитать dconf db 14.04 с помощью chroot, если ваш 14.04 все еще загрузочный, загрузите его, затем используйте dconf read ..., чтобы получить список. В противном случае напишите список вручную с ls ~/.local/share/applications.