В случае, если кто-то приземлится здесь, чтобы найти способ изменить настройки терминала с консоли (например, для бродячих положений), можно использовать команду gconftool-2. Например:
gconftool-2 --set /apps/gnome-terminal/profiles/Default/background_darkness --type=float 0.50
Вы можете получить соответствующие установочные ключи из файла ~/.gconf/apps/gnome-terminal/profiles/Default/%gconf.xml.