У меня была аналогичная проблема с элементарной темой. Хотя проблема заключалась в том, что полосы прокрутки были слишком тонкими. Исправление заключалось в том, чтобы изменить ширину полосы прокрутки в файле gtkrc, в моем случае:
/usr/share/themes/elementary Dark/gtk-2.0/gtkrc
найти:
GtkScrollbar ::slider-width
и установить значение примерно на 10