Обычно вы можете использовать:
make uninstall
или
sudo make uninstall
, если приложение установлено как root.
Но это будет работать только если разработчик пакета позаботился о правильном правиле удаления.
Вы также можете попытаться просмотреть шаги, используемые для установки программного обеспечения, запустив:
make -n install
Затем попробуйте вручную отменить эти шаги.
В будущем, чтобы избежать подобных проблем, попробуйте использовать checkinstall вместо make install, когда это возможно (AFAIK всегда, если вы не хотите, чтобы скомпилированные и упакованные версии одновременно). Он создаст и установит файл deb, который вы сможете удалить, используя ваш любимый менеджер пакетов.
make clean обычно очищает каталоги зданий, он не удаляет пакет. Он используется, когда вы хотите быть уверенным, что все это скомпилировано, а не только измененные файлы.