Прежде всего, вы пропустили слово, вы должны использовать
sudo apt-get --purge remove samba
или просто
sudo apt-get purge samba
. Кстати, файл конфигурации создается и удаляется в После установки / удаления сценариев пакета samba-common, который установлен по умолчанию, так как необходим также для клиента samba.
Таким образом, файл smb.conf будет удален только автоматически, если вы удалите этот пакет , но не рекомендуется делать это, не нарушая установку по умолчанию.