На 2 совершенно разных машинах после обновления с 13.04 до 13.10 у меня возникает та же проблема: все программы / задачи, требующие разрешения sudo (средство обновления программного обеспечения, запуск synaptic, установка программ, завершение работы), не запускаются / не выполняются. Окно ГКСУ (или другое) не появляется. Synaptic никогда не отображается, программа обновления программного обеспечения выскакивает с сообщением «Вы не можете выполнять это действие».
Все программы / задачи работают при запуске из терминала с помощью sudo, например «sudo synaptics» запрашивает мой пароль, запускается и работает как положено.
Я нахожусь в группе администраторов, которая нравится в конфигурации sudoers (проверено с помощью admin группы visudo и getent).
Некоторая ссылка из GUI на gksu (или аналогичную) не работает.
Я нашел решение здесь
https://bugs.launchpad.net/ubuntu/+source/policykit-desktop-privileges/+bug/1240336/comments/19 [ 113]
sudo pam-auth-update --force