Как установить NumPy и Scipy для Python?

Хорошо, позволяет, следуют инструкции по установке:

1. Это говорит необходимость в python 2.7 (который Вы уже имеете):

   $ python --version
   Python 2.7.4
   

2. Затем это говорит необходимость в numpy пакете также, версия> = 1.4.1:

   apt-cache policy python-numpy
   python-numpy:
   Installed: (none)
   Candidate: 1:1.7.1-1ubuntu1
   Version table:
    1:1.7.1-1ubuntu1 0
       500 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ raring/main amd64 Packages

   Как Вы видите, у меня есть доступная numpy версия 1.7.1, поэтому позволяет, продолжают устанавливать его:

   sudo apt-get install python-numpy
   

3. Теперь это говорит, что нам нужен цитон, позволяет проверке, если тот пакет является availabe:

   apt-cache policy cython
   cython:
   Installed: (none)
   Candidate: 0.17.4-0ubuntu1
   Version table:
    0.17.4-0ubuntu1 0
       500 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ raring/main amd64 Packages

   У нас есть он, мы устанавливаем его:

   sudo apt-get install cython
   

   Действительно заметьте, что существуют другие пакеты, которые являются зависимостью, которые устанавливаются также.

4. Достаточно странно нам также нужен scipy модуль также:

   sudo apt-get install python-scipy
   

5. Тестирование. Открытый Python в терминале и типе следующее:

   $ python
   Python 2.7.4 (default, Sep 26 2013, 03:20:26) 
   [GCC 4.7.3] on linux2
   Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
   >>> import numpy
   >>> import scipy
   >>> import cython
   >>> exit()
   

   Вышеупомянутое, должен быть без ошибок. Если что-то пошло не так, как надо, поднимитесь и прочитайте руководство снова, Вы забыли/пропустили шаг.

6. При загрузке источников КЛАССА с их страницы перейдите к каталогу в терминале и untar это и сделайте его:

   cd where/the/tar/is
   tar zxf class_v2.0.2.tar.gz
   cd class_v2.0.2
   make

   Здесь мы будем ожидать, до завершено. После того как это сделано, мы переходим к каталогу Python и запускаем волшебство. Не перемещаясь из каталогов выполняет это:

   cd python
   python setup.py build
   python setup.py install --user

   Теперь нам установили КЛАСС в нашем пользовательском каталоге. Мы должны протестировать его!

   python
   Python 2.7.4 (default, Sep 26 2013, 03:20:26)
   [GCC 4.7.3] on linux2
   Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
   >>> from classy import Class
   >>> exit()
   

   Все хорошо cozzy до здесь.

7. Теперь время истины, загрузите monthypython tarball в Вашем каталоге кода:

   cd ~
   mkdir code
   cd code
   wget https://www.dropbox.com/s/l7mnhwsktp1m8b5/montepython_v1.2.5.tar.bz2?dl=1 -O montepython_v1.2.5.tar.bz2
   tar jxf montepython_v1.2.5.tar.bz2

   В инструкциях по установке некоторые примечания, которые не релевантны в этом специфическом случае (новая установка), но может быть важно при обновлении montepython.

8. Это изменение важно. Вы помните, где Вы установили КЛАСС? Теперь необходимо ли сказать Monte Python, где это. В моем случае это /home/braiam/src/class_v2.0.2/class, Ваш может отличаться. Можно использовать find искать его:

   find ~ -name class -print
   

   Ну, теперь я изменяю default.conf файл с помощью то, независимо от того, что Вам нравится (я буду использовать нано) и изменяет root путь, таким образом, полный файл будет, похож:

   # Fill in the relevant path to your personal distribution. 
   # If you create a new file out of this one, please remember to call
   # MontePython.py with the option '-conf my.conf'
   
   # At minimum, this file should contain one line:
   # ** path['cosmo'] =  path to the cosmological code you are using. Note, if you are
   # using a modified version of class, be sure that the path contains the word
   # class, otherwise the code might not recognise it.
   
   # If you want to use a data folder different from the one present in the folder
   # you are executing the code, please also add:
   # ** path['data']  =  /path/to/the/other/data/
   
   root = '/home/braiam/src/class_v2.0.2/'
   
   path['cosmo']           = root+'/class/'
   

   Сохраните файл и выход.

9. Тест montepython! Если бы все было в порядке, то необходимо смочь работать code/MontePython.py --help в Вашем montepythong каталоге и все должно работать:

   ~/src/montepython$ code/MontePython.py --help
   usage: MontePython.py [-h] [-N number of steps] [-o output folder]
                     [-p input param file] [-c input cov matrix]
                     [-j jumping method] [-f jumping factor]
                     [-conf configuration file] [-chain_number chain number]
                     [-r restart from chain] [-bf restart from best fit file]
                     [-info [compute information of desired file [compute information of desired file ...]]]
                     [-bins desired number of bins, default is 20] [-no_mean]
                     [-comp comparison folder]
                     [-extra plot file for custom needs] [-noplot] [-all]
                     [-ext change extension for the output file]
                     [-fontsize desired fontsize, default is 15]
                     [-ticksize desired ticksize, default is 13]
   
   Monte Python, a Monte Carlo code in Python
   
   optional arguments:
   -h, --help            show this help message and exit
   -N number of steps
   -o output folder
   -p input param file
   -c input cov matrix
   -j jumping method
   -f jumping factor
   -conf configuration file
   -chain_number chain number
   -r restart from chain
   -bf restart from best fit file
   -info [compute information of desired file [compute information of desired file ...]]
   -bins desired number of bins, default is 20
   -no_mean
   -comp comparison folder
   -extra plot file for custom needs
   -noplot
   -all
   -ext change extension for the output file
   -fontsize desired fontsize, default is 15
   -ticksize desired ticksize, default is 13

С этим у Вас есть montepython, установленный и готовый прокрутиться!