Как удалить подпапки, но сохранить все файлы?

Вопрос невозможен. Вы не можете удалить каталог, не повредив файлы внутри него.

может сработать комбинация из двух приведенных выше ответов.

шаг 1.

find oldLocation -type f -exec mv {} newLocation \;   #find and copy all files.

шаг 2.

rm -frv oldLocation 

Возможно, вы захотите перефразировать ваши вопросы, не очень понятно, какое поведение вы хотите.

Принятие Вас имеет каталог, где Вы хотите удалить все подкаталоги и любые файлы и каталоги, они содержат, но сохраняют файлы, которые были в исходном каталоге, можно сделать

find your_directory -maxdepth 1 -type d -exec rm -rf {} \;

Так, учитывая дерево как

/path/to/dir1
|_ _ _ _ subdir1
|           |_ _ _ _ file1
|           |_ _ _ _ file2
|
|_ _ _ _ subdir2
|
|_ _ _ _ file3
|
|_ _ _ _ file4

выполнение

find /path/to/dir1 -maxdepth1 -type d -exec rm -rf {} \;

оставит Вас с

/path/to/dir1    
|
|_ _ _ _ file3
|
|_ _ _ _ file4

Хм, я предполагаю, что вы хотите сохранить файлы в новой папке, верно?

Внимание: убедитесь, что вы находитесь в правильном каталоге. Убедитесь, что вы делаете тестовый прогон в первую очередь. Убедитесь, что в разных каталогах нет файлов с одинаковыми именами.

mv */* /path/to/new/folder
rmdir *

Все становится немного сложнее, если у вас более одного уровня, например у вас есть подпапки подпапок, и вы хотите переместить обычные файлы и удалить каталоги. В этом случае

find . -type f -exec mv {} /path/to/new/folder \;
find . -type d -exec rm -rf {} \;

Давайте сделаем вызов еще более интересным. Скажем, мы хотим переместить файлы, но мы хотим изменить имена так, чтобы они отражали структуру каталогов. Например, если в текущем каталоге есть файл foo.jpg в ./blah/pah/oh/, то мы хотим переименовать его в blah_pah_oh_foo.jpg. По соображениям безопасности мы можем скопировать его вместо перемещения.

for i in `find . -type f -print` ; do \
  newname=`echo $i | sed 's/^\.\///;s/\//_/g'` ; \
  echo moving $i to $newname ; \
  mv $i $newname ; \
done

Я знаю, что можно удалить все файлы, но сохранить каталоги с помощью этой команды:

find . -name *.* -exec rm -f {} \;

Но я не верю, что существует противоположный путь.

Я собираюсь предположить, что у вас есть папка, подобная этой:

dir
 subdir1  <--directory
 subdir2  <--directory
 file.txt <--file
 foo.mp3  <--file
 bar.pdf  <--file

... и вы просто хотите удалить две подкаталоги и все, что они содержат, оставляя файлы нетронутыми. Просто используйте:

rm -r */

Конечный слеш гарантирует, что он будет соответствовать только каталогам (и ссылкам на каталоги).

Хотя ваш вопрос довольно расплывчатый, отредактируйте его, чтобы было понятно, чего вы на самом деле хотите.