На этот вопрос уже есть ответ здесь:
Я хочу отформатировать свою систему, но я не хочу потерять свои обновления и установленные пакеты. Мне также нужны такие же пакеты и в других системах.
Резервное копирование должно быть:
dpkg --get-selections > ~/Package.list
sudo cp /etc/apt/sources.list ~/sources.list
sudo apt-key exportall > ~/Repo.keys
и восстановление должно быть
sudo apt-key add ~/Repo.keys
sudo cp ~/sources.list /etc/apt/sources.list
sudo apt-get update
sudo apt-get install dselect
sudo dpkg --set-selections < ~/Package.list
sudo apt-get dselect-upgrade -y
... Если я не ошибаюсь.