Проблемы с установкой Mothur 39.5 (файл не найден)

Андерссон смог решить проблему, используя этот ответ.

Скопируйте рабочий файл / etc / default / keyboard в каталог, содержащий файл Docker. Добавьте следующую строку в свой файл Docker перед установкой xdm или lightdm.
COPY ./keyboard /etc/default/keyboard
Пример файла клавиатуры:
# Check /usr/share/doc/keyboard-configuration/README.Debian for
# documentation on what to do after having modified this file.

# The following variables describe your keyboard and can have the same
# values as the XkbModel, XkbLayout, XkbVariant and XkbOptions options
# in /etc/X11/xorg.conf.

XKBMODEL="pc105"
XKBLAYOUT="us"
XKBVARIANT="intl"
XKBOPTIONS=""

# If you don't want to use the XKB layout on the console, you can
# specify an alternative keymap.  Make sure it will be accessible
# before /usr is mounted.
# KMAP=/etc/console-setup/defkeymap.kmap.gz
BACKSPACE="guess"
2
задан 4 April 2018 в 16:12

6 ответов

Вам не нужно строить mothur из источника. Mothur.linux_64.zip готов к выполнению.

$ wget https://github.com/mothur/mothur/releases/download/v1.39.5/Mothur.linux_64.zip
$ unzip Mothur.linux_64.zip
$ cd mothur
$ ./mothur

дает следующее:

mothur v.1.39.5 Последнее обновление: 3/20/2017 [...] mothur >
1
ответ дан 22 May 2018 в 11:37
  • 1
    отлично это получилось! большое спасибо! – Cota 4 April 2018 в 16:46

Вам не нужно строить mothur из источника. Mothur.linux_64.zip готов к выполнению.

$ wget https://github.com/mothur/mothur/releases/download/v1.39.5/Mothur.linux_64.zip $ unzip Mothur.linux_64.zip $ cd mothur $ ./mothur

дает следующее:

mothur v.1.39.5 Последнее обновление: 3/20/2017 [...] mothur >
1
ответ дан 17 July 2018 в 17:30

Вам не нужно строить mothur из источника. Mothur.linux_64.zip готов к выполнению.

$ wget https://github.com/mothur/mothur/releases/download/v1.39.5/Mothur.linux_64.zip $ unzip Mothur.linux_64.zip $ cd mothur $ ./mothur

дает следующее:

mothur v.1.39.5 Последнее обновление: 3/20/2017 [...] mothur >
1
ответ дан 23 July 2018 в 18:19

Mothur.linux_64.zip содержит исполняемый файл, который уже скомпилирован. Вам не нужно его строить; вы можете просто запустить его. Если у вас есть cd ed в распакованном каталоге mothur, который содержит файл, который также называется mothur, вы можете просто запустить команду:

./mothur

Вы можете захотеть распаковать mothur (или переместите распакованный каталог), где бы вы ни захотели, а затем поместите символическую ссылку на исполняемый файл mothur где-нибудь в вашем PATH.

Если вы можете запустить программу, но то вам нужна информация о том, как его использовать, вы можете ввести help() в приглашение, которое оно дает вам, в котором перечислены все доступные команды, а также ссылки для документации.

Если вы действительно хотите скомпилировать его из источника кода, то вам придется загрузить исходный код, который, как говорит pim, вы можете сделать, получив файл .tar.gz с надписью «Исходный код» на странице загрузки. Но на основании того, что вы просили, у меня нет причин думать, что вам действительно нужно или чего хочет. С тем, что у вас есть, вы должны иметь возможность запускать программу; он уже скомпилирован для вас, поэтому сначала его не нужно скомпилировать.

1
ответ дан 22 May 2018 в 11:37
  • 1
    +1, потому что вы были на 5 секунд быстрее меня ;-) – RoVo 4 April 2018 в 16:32

Mothur.linux_64.zip содержит исполняемый файл, который уже скомпилирован. Вам не нужно его строить; вы можете просто запустить его. Если у вас есть cd ed в распакованном каталоге mothur, который содержит файл, который также называется mothur, вы можете просто запустить команду:

./mothur

Вы можете захотеть распаковать mothur (или переместите распакованный каталог), где бы вы ни захотели, а затем поместите символическую ссылку на исполняемый файл mothur где-нибудь в вашем PATH.

Если вы можете запустить программу, но то вам нужна информация о том, как его использовать, вы можете ввести help() в приглашение, которое оно дает вам, в котором перечислены все доступные команды, а также ссылки для документации.

Если вы действительно хотите скомпилировать его из источника кода, то вам придется загрузить исходный код, который, как говорит pim, вы можете сделать, получив файл .tar.gz с надписью «Исходный код» на странице загрузки. Но на основании того, что вы просили, у меня нет причин думать, что вам действительно нужно или чего хочет. С тем, что у вас есть, вы должны иметь возможность запускать программу; он уже скомпилирован для вас, поэтому сначала его не нужно скомпилировать.

1
ответ дан 17 July 2018 в 17:30

Mothur.linux_64.zip содержит исполняемый файл, который уже скомпилирован. Вам не нужно его строить; вы можете просто запустить его. Если у вас есть cd ed в распакованном каталоге mothur, который содержит файл, который также называется mothur, вы можете просто запустить команду:

./mothur

Вы можете захотеть распаковать mothur (или переместите распакованный каталог), где бы вы ни захотели, а затем поместите символическую ссылку на исполняемый файл mothur где-нибудь в вашем PATH.

Если вы можете запустить программу, но то вам нужна информация о том, как его использовать, вы можете ввести help() в приглашение, которое оно дает вам, в котором перечислены все доступные команды, а также ссылки для документации.

Если вы действительно хотите скомпилировать его из источника кода, то вам придется загрузить исходный код, который, как говорит pim, вы можете сделать, получив файл .tar.gz с надписью «Исходный код» на странице загрузки. Но на основании того, что вы просили, у меня нет причин думать, что вам действительно нужно или чего хочет. С тем, что у вас есть, вы должны иметь возможность запускать программу; он уже скомпилирован для вас, поэтому сначала его не нужно скомпилировать.

1
ответ дан 23 July 2018 в 18:19
  • 1
    +1, потому что вы были на 5 секунд быстрее меня ;-) – RoVo 4 April 2018 в 16:32

Другие вопросы по тегам:

Похожие вопросы: