Короткий вариант для нетерпеливого:
dev=/dev/sdXn # <-- Adjust this
then
umount $dev && tune2fs -O extents,uninit_bg,dir_index,has_journal $dev && e2fsck -v -pf $dev
Если вы не можете размонтировать, потому что это ваш системный раздел, тогда, конечно, вам нужно будет сначала загрузить из другой системы, такой как Live CD.
И нет, вы не потеряете данные. Если не произойдет что-то очень странное, в этом случае вам придется обратиться к своей резервной копии. (У вас есть резервные копии, конечно.)?
В качестве альтернативы вы можете включить некоторые функции ext4, выполнив следующую команду и перезагрузив:
sudo tune2fs -O has_journal,uninit_bg,extents /dev/sda1