На этот вопрос уже есть ответ здесь:
Когда я запускаю Chrome он проявляется в определенном размере в верхнем левом углу моего экрана. Каждый раз мне приходится вручную изменять его размер и размещать в центре экрана.
Как изменить размер и положение окна на экране при запуске?
Если это так, вы можете указать положение окна при запуске с помощью плагинов Compiz «Поместить Windows»: «Система -> Настройки -> Диспетчер настроек CompizConfig -> Управление окнами -> Поместить Windows»
Попробуйте Сначала отрегулируйте «Режим размещения» (вкладка «Общие»), кажется, что вы выбрали «Центр», по умолчанию «Умный».