Поместите команды sudo в скрипт на строках, для которых вам нужны привилегии для запуска. Затем запустите нормально.
После запуска команды fsck.vfat мне сказали, что установлен грязный бит, что, вероятно, было вызвано нечистым отключением. Сначала я согласился очистить этот бит, а затем предложил исправить блоки в первом разделе, который я отклонил. После повторного подключения Kindle назад он был установлен как раздел RW. Спасибо за подсказку!