Я ищу мессенджер, который позволяет мне выбирать, кому я хочу показываться в сети, а кому - в автономном режиме (например, Windows Live Messenger в Windows).
Есть ли что-нибудь, что могло бы сделать работу в Linux?
Это будет зависеть от конкретной службы, к которой вы подключаетесь, поскольку клиенты Linux не контролируют действия сервера, когда ему сообщают, что вы подключены к сети. Некоторые (например, чат в Facebook) просто не предоставляют возможность выборочно отображаться как онлайн или офлайн - и с этим ничего не может поделать любой клиент (будь то в Linux или Windows).
Если вы говорите, что есть особая функция службы Windows Live, которая позволяет это, то я не знаю, какие (если таковые имеются) клиенты Linux поддерживают ее. Но если это не доступно ни в Pidgin, ни в Empathy (что я не верю в это), то я сильно сомневаюсь, что оно будет доступно в любых других.