Не удалось найти пакет pkgconfig

По моему мнению, ваша проблема не учитывает перегрев, но скорость вращения вентилятора.

Если вентилятор вращается слишком быстро, он также громче (но система не нагреватель, совсем наоборот). Infact, если температура воздуха, который выливается из вашего ноутбука, выше, что означает, что температура ПК более холодная:)

Вы можете попытаться настроить скорость вращения вентилятора либо на BIOS вашего ПК (если разрешено ) или с помощью пакета lm_sensors (который вы можете найти в Центре программного обеспечения Ubuntu).

http://www.lm-sensors.org/