Если я скопирую установочные файлы Ubuntu на USB, удалит ли он все на этом диске?

Нет, никакие другие действия не должны выполняться, кроме того, который вы запрашиваете у вашего ПК, копируйте файлы.

Если вы хотите сделать так, чтобы LiveUSB устанавливался из no, существующие файлы не будут удалены программой «автозагрузка диска». USB-флешку уже нужно будет отформатировать как FAT, однако таблица разделов должна быть приемлемой для программы, и для нее потребуется достаточно места для iso и файла постоянства.

Другие создатели загрузочных USB-устройств могут работать по-другому.