Измените /etc/systemd/logind.conf и установите HandleLidSwitch=lock, чтобы заблокировать экран на закрытой крышке (но не приостанавливать), или HandleLidSwitch=ignore, чтобы даже заблокировать экран.
Это связано с изменением GNOME вверх. См. Ошибку GNOME 687277 для обоснования этого изменения.