На этот вопрос уже есть ответ:
Я почему-то пропустил возможность шифрования моей домашней папки, когда обновление до 12.04. В 11.10 он не был зашифрован. Как я могу сделать это без переустановки? Или я могу? Я новичок в Ubuntu, поэтому, пожалуйста, сделайте это для меня.
Вот отличный учебник. http://www.makeuseof.com/tag/encrypt-home-folder-ubuntu-installation-linux/ Он был написан для 11.10, но он должен быть примерно одинаковым.