Обычно я использую rsync
или rdiff-backup
для копирования или перемещения большого количества файлов с активированной проверкой.
Я не знаю, использует ли Наутилус какую-либо проверку команд копирования или перемещения.
В настоящее время в nautilus нет настройки для проверки скопированных файлов.
У Наутилуса есть страница мозгового штурма для идей, поэтому, возможно, вы сможете добавить свой запрос туда.