Я хотел бы иметь возможность использовать Ubuntu One на USB-диске в дороге. Должен быть способ иметь «переносной профиль», который синхронизирует только определенные вещи.
Нет. Ubuntu One поддерживает только синхронизацию папок в домашнем каталоге вашего пользователя (или в папке профиля, как она называется в Windows).