почему мой скрипт в /etc/init.d с символьной ссылкой K в rc0.d и rc6.d и символической ссылкой S в rc5.d не работает при завершении работы?

Вы можете создать общий репозиторий Git на частном сервере с доступом SSH. Например, для этого я использую для этого учетную запись nearfreespeech.net, а стоимость очень низкая.

Если вы хотите получить фантазию, вы можете создать скрипт cron для автоматического нажатия / вытаскивания изменений так часто, всегда сохраняя свои файлы в актуальном состоянии. Пока вы не работаете на двух машинах одновременно, вы никогда не должны сталкиваться с конфликтами слияния.