Как объединить или автоматически скомпилировать разные программы, такие как python3, R (3.5.6) и sageMath 8.3

Хотя я бы рекомендовал Dropbox (лучшее кросс-платформенное решение), если все ваши рабочие станции основаны на Ubuntu, вы можете использовать Ubuntu One. Если вы ищете что-то более мощное, посмотрите rsync.