cat countts.txt | Rscript deseq1.r 3x3> results_deseq1.txt Загрузка требуемого пакета: BiocGenerics Загрузка требуемого пакета: параллельный
Присоединение пакета: «BiocGenerics»
Следующие объекты маскируются из «package: parallel»: [ 116]
clusterApply, clusterApplyLB, clusterCall, clusterEvalQ,
clusterExport, clusterMap, parApply, parCapply, parLapply,
parLapplyLB, parRapply, parSapply, parSapplyLB
Следующие объекты маскируются из 'package: stats':
IQR, mad, sd, var, xtabs
Следующие объекты маскируются из 'package: base':
Filter, Find, Map, Position, Reduce, anyDuplicated, append,
as.data.frame, basename, cbind, colMeans, colSums, colnames,
dirname, do.call, duplicated, eval, evalq, get, grep, grepl,
intersect, is.unsorted, lapply, lengths, mapply, match, mget,
order, paste, pmax, pmax.int, pmin, pmin.int, rank, rbind,
rowMeans, rowSums, rownames, sapply, setdiff, sort, table, tapply,
union, unique, unsplit, which, which.max, which.min
Загрузка требуемого пакета: Biobase
Добро пожаловать в Bioconductor
Vignettes contain introductory material; view with
'browseVignettes()'. To cite Bioconductor, see
'citation("Biobase")', and for packages 'citation("pkgname")'.
Загрузка требуемого пакета: locfit locfit 1.5-9.1 2013-03-22 Загрузка требуемого пакета: решетка Добро пожаловать в 'DESeq'. Для повышения производительности, удобства использования и функциональности рассмотрите возможность перехода на «DESeq2». Ошибка в цикле (x): нечисловой аргумент математической функции Вызовы: apply -> FUN Выполнение остановлено (bioinfo)