На этот вопрос уже есть ответ:
Если я обновлю ubuntu с 13.04 до 13.10,
Он удалит все установленное программное обеспечение ..?
Он удалит все мои данные ..?
Я совершенно не знаком с убунту.
Все ваши настройки, файлы в вашем / home каталоге и персональное программное обеспечение будут сохранены.
Однако рекомендуется заранее сделать резервную копию на случай, если обновление выведет вашу операционную систему из строя. Вероятность этого не должна быть большой.