Добавление пользовательских изменений в OpenBlas for Python

Мой вопрос: Как заставить Python использовать мою собственную скомпилированную версию OpenBLAS?

Справочная информация

Руководство по установке Theano предполагает, что Следует проверить, что связанные компоненты библиотеки BLAS правильно оптимизированы с помощью следующих команд:

THEANO_FLAGS=floatX=float32,device=cpu python `python -c "import os, theano; print os.path.dirname(theano.__file__)"`/misc/check_blas.py 
THEANO_FLAGS=floatX=float32,device=gpu python `python -c "import os, theano; print os.path.dirname(theano.__file__)"`/misc/check_blas.py

Результаты:

Карта: GTX 770
Результаты по CPU 0.62s и GPU 0.11s

Не уверен, были ли эти результаты хорошими, я решил сравнить различные библиотеки, как это сделано в в этом посте . Поскольку научные вычисления требуют всякого ускорения, это казалось хорошей идеей.

Компиляция и установка OpenBLAS из GitHub

Для тестирования последней версии я:

  1. клонировал git git clone https://github.com/xianyi/OpenBLAS.git
  2. вошел в каталог и сделал make TARGET=HASWELL (ЦЕЛЬ не является действительно необходимой, поскольку он обнаруживает это автоматически)
  3. , сопровождаемый make PREFIX=/opt/OpenBLAS install.
  4. скопировали файлы в lib (libopenblas.a libopenblas_haswellp-r0.2.14.a libopenblas_haswellp-r0.2.14.so libopenblas.so libopenblas.so.0) в /usr/lib/openblas-haswell_cstm/
  5. добавили альтернативу через sudo update-alternatives --install /usr/lib/libblas.so.3 libblas.so.3 /usr/lib/openblas-haswell_cstm/libopenblas.so.0 30

К сожалению, это дает ошибку:

$ sudo update-alternatives --config libblas.so.3 
There are 4 choices for the alternative libblas.so.3 (providing /usr/lib/libblas.so.3).

  Selection    Path                                             Priority   Status
------------------------------------------------------------
  0            /usr/lib/openblas-base/libblas.so.3               40        auto mode
* 1            /usr/lib/atlas-base/atlas/libblas.so.3            35        manual mode
  2            /usr/lib/libblas/libblas.so.3                     10        manual mode
  3            /usr/lib/openblas-base/libblas.so.3               40        manual mode
  4            /usr/lib/openblas-haswell_cstm/libopenblas.so.0   30        manual mode

Press enter to keep the current choice[*], or type selection number: 4
update-alternatives: using /usr/lib/openblas-haswell_cstm/libopenblas.so.0 to provide /usr/lib/libblas.so.3 (libblas.so.3) in manual mode
max@MaxLin:~/tutorials$ python
Python 2.7.8 (default, Oct 20 2014, 15:05:19) 
[GCC 4.9.1] on linux2
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>> import numpy
Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/__init__.py", line 153, in <module>
    from . import add_newdocs
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/add_newdocs.py", line 13, in <module>
    from numpy.lib import add_newdoc
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/lib/__init__.py", line 18, in <module>
    from .polynomial import *
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/lib/polynomial.py", line 19, in <module>
    from numpy.linalg import eigvals, lstsq, inv
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/linalg/__init__.py", line 50, in <module>
    from .linalg import *
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/linalg/linalg.py", line 29, in <module>
    from numpy.linalg import lapack_lite, _umath_linalg
ImportError: /usr/lib/liblapack.so.3: undefined symbol: gotoblas

Я не уверен, связано ли это с тем, что скомпилированная версия не является .so.3 версия . Я попытался использовать libopenblas_haswellp-r0.2.14.so и libopenblas.so, созданные в make, но это не влияет на ошибку.

1
задан 13 April 2017 в 15:37

1 ответ

если Вы хотите создать пользовательский пакет Debian, я рекомендую, который Вы запускаете с существующего openblas пакет и , Как загрузить, изменить, создайте и установите исходный пакет Debian? .

можно изменить имя пакета и имена файлов библиотеки, если Вы чувствуете, что Ваш пакет не полностью заменяет обеспеченный.

0
ответ дан 14 April 2017 в 01:37

Другие вопросы по тегам:

Похожие вопросы: