Каковы последствия компиляции пакетов из исходного кода?

Каковы последствия компиляции пакетов из исходного кода? Например, что если обновление sudo apt-get обновляет зависимость установленного вручную пакета? Чем отличается использование пакета от PPA в этом отношении?

Еще одним следствием является то, что он не может автоматически обновляться системой управления пакетами (как бы вы обновили его вручную, чтобы сохранить настройки пакета, если он application)?

Я хочу обеспечить разумную совместимость и стабильность при использовании некоторых программ, которые должны быть скомпилированы из исходного кода (недоступны в репозиториях по умолчанию или сторонних репозиториях). Есть ли способы сделать это возможным? А как насчет пакета из PPA?

Спасибо!