Ubuntu поставляется с командой rename, которая может переименовывать файлы с помощью регулярных выражений.
Если все ваши файлы находятся в одной папке, вы можете просто сделать следующее:
(\\* - это экранированный *, $ - это конец имени файла. Матч будет заменен ничем.)
Если все ваши файлы находятся в каталоге структуру, вы можете использовать find:
find / -exec rename s/\\*$// {} \;
Выполняет rename /\\*$// для каждого файла и каталога в вашей системе. Не стесняйтесь изменять / в папку, в которой находится структура каталогов.