Как сказал Кис, запуск unity --reset приведет к сбросу всех параметров запуска, но он не удалит ваши избранные избранные. Чтобы удалить все пусковые установки, добавленные в пусковую установку, запустите
unity --reset-icons
Или вручную:
gsettings reset com.canonical.Unity.Launcher favorites
Я бы рекомендовал запустить команду gsettings до unity --reset, так что вам не придется перезапускать единицу для сброса ключа gsettings.