В настоящее время у меня установлена Ubuntu и пустой раздел для установки Windows (NTFS).
Если я начну восстановление после загрузки Windows, восстановится ли функция двойной загрузки?
Вы можете использовать https://help.ubuntu.com/community/Grub2/Install#Fixing_a_Broken_System для руководства по исправлению grub после установки windows.