Вы можете использовать пакет equivs для создания фиктивного пакета для подделки установленного пакета. Некоторые инструкции здесь.
У меня была та же проблема с другим пакетом libamd2.3.1: amd64. Я получил эту ошибку:
> sudo apt upgrade
[...]
Errors were encountered while processing:
libamd2.3.1:amd64
E: Sub-process /usr/bin/dpkg returned an error code (1)
После этого потока мне удалось удалить его с помощью dpkg и переустановить с помощью apt.
sudo dpkg --remove --force-remove-reinstreq libamd2.3.1:amd64
sudo apt-get install libamd2.3.1:amd64