Только некоторые выбранные программы могут получить доступ к Интернету, как это исправить?

Жесткие диски обычно не работают. Я бы рекомендовал быть нежным с ними, пока они вращаются, и чтобы они были закрыты (или спали), прежде чем перемещать их. Кроме того, проверьте инструменты SMART, чтобы обнаружить, что что-то не так.

https://help.ubuntu.com/community/Smartmontools