В терминале мы можем изменить прозрачность фона, изменив ползунок в
edit>preference>background>transparent background
Точно так же, как мы можем изменить прозрачность фона xterm
xterm не имеет созданным в прозрачности, от того, что я знаю. Можно быть в состоянии использовать составляющий композит менеджер окон для изменения прозрачности xterm окна, но я думаю, что Вам будет трудно делать это исходно в xterm.
Вот полное решение Вашей проблемы, которую можно использовать на ubuntu https://wiki.archlinux.org/index.php/Xterm#Automatic_transparency