На самом деле вы можете исправить это просто, выполнив
sudo rm /usr/share/mime/packages/kde.xml
sudo update-mime-database /usr/share/mime
Вот цитата из Ana Guerrero в 2008 году, поэтому вы думаете, что она будет исправлена к настоящему времени.
fake mimetypes установлены kdelibs с файлом /usr/share/mime/packages/kde.xml с давних времен. Они хранятся в kde4libs. В недавней версии update-mime-database стало многословным об этих неизвестных типах, и именно поэтому вы получаете эту ошибку при обновлении материала, а затем запускаете update-mime-database. Это вряд ли изменится.