В принципе, это все о лучшей производительности. Если это действительно так важно для современных SSD-накопителей - кто знает, но выравнивание раздела не повредит.
В любом случае установщик Ubuntu автоматически выравнивает разделы. Первый раздел начинается в секторе 2048, то есть после 2048 секторов: 512 байтов = 1 MiB, а 1 MiB равномерно распределяется по всем общим размерам блоков SSD.
2016-02 У меня также исчезли мои значки.
Исправлено, выбрав «Системные настройки -> Внешний вид» и выбрав тему, значение было пустым.