Аккумулятор ноутбука умер, многие настройки рабочего стола, кажется, исчезли

Аккумулятор моего ноутбука разрядился, когда я заходил в свой ноутбук этим утром. Я подключил его и загрузился обратно. Теперь я заметил, что моя тема значков изменилась, и на панели приложения слева отсутствует множество ярлыков, которые я часто использую. Моя настройка правого клика также испорчена. Все мои уведомления о приложении исчезли в верхнем правом углу. Это все, что я заметил до сих пор, но я уверен, что это еще не все.

Прежде, чем я начну вносить изменения и наносить какой-либо ущерб моим шансам на восстановление вещей, я должен что-то сделать или попытаться сделать, чтобы вернуть вещи такими, какими они были? Я использую ванильную Ubuntu 18.04, поэтому GNOME.