Сегодня была выпущена новая версия Arduino IDE (1.6.9). Я думаю, что Ubuntu Make еще не обновлена. Но откуда мне это знать?
Ubuntu Делает, говорит, что она выбирает последний восходящий выпуск разработки и компилирует его из источника. Если сайт для скачивания Ардуино был обновлен для нового выпуска, Ubuntu Делают, должен использовать его автоматически.