На этот вопрос уже есть ответ здесь:
Мне нравится Nautilus больше, чем Thunar, поэтому я использую Nautilus на Xubuntu, но Thunar все еще находится на рабочем столе. Могу я как-нибудь это переключить?
Замените Thunar Наутилусом в конфигурации сессии Xubuntu:
sudo nano /etc/xdg/xdg-xubuntu/xfce4/xfconf/xfce-perchannel-xml/xfce4-session.xml
От:
<property name="Client3_Command" type="array">
<value type="string" value="Thunar"/>
<value type="string" value="--daemon"/>
</property>
К:
<property name="Client3_Command" type="array">
<value type="string" value="nautilus"/>
<value type="string" value="--no-default-window"/>
</property>