Я добавляю в свой менеджер запуска Ubuntu 16.04 следующую команду.
/usr/lib/virtualbox/VirtualBox --comment "WINDOWS 7" --startvm "22591f38-3b08-4240-b2dc-b0f62714ee99"
Но вопрос в том, могу ли я сделать что-нибудь для запуска виртуальной машины со скрытым или свернутым запуском.
Да, существует путь, если Вы хотите записать сценарий. См. ответ на подобный вопрос на этом сайте для примера от кого-то более хорошо осведомленного, чем я:
Как я могу запустить программу на запуске, минимизированном?