Создайте сценарий запуска.
Откройте текстовый редактор, добавьте это:
#!/bin/bash
mono foo.exe &
В зависимости от вашей установки вам может понадобиться полный путь для foo. exe.
Сохраните файл, например, как foo.sh.
Сделайте его исполняемым:
sudo chmod a+x foo.sh
Теперь вы можете запустить foo.exe, дважды щелкнув foo.sh.