Установка на раздел NTFS

Вы можете (но не должны) дать root пользователю пароль с помощью

sudo passwd root

Изменить: бит Setuid не работает для скриптов. В противном случае вы могли бы использовать бит setuid в программе резервного копирования.

sudo chown root backup
sudo chmod u+s backup

Возможно, вы даже хотите запустить резервную копию как задание cron?