Поскольку система apt является общесистемной, любые установки и удаления затрагивают все учетные записи. Поскольку Wine конфликтует с арабскими шрифтами, я предлагаю вам получить файлы шрифтов и пометить их в ~/.fonts.
Также рассмотрите использование виртуальных машин. Поскольку каждый из них имеет отдельный виртуальный жесткий диск, у каждого есть свои собственные программы и конфигурация apt.