С помощью «xdotool» вы можете легко взаимодействовать с окнами, используя события клавиатуры или мыши.
Пример отправки последовательности ctrl-c в активное окно:
xdotool getwindowfocus key ctrl-c # Sends CTRL-C to the current window.
Если вам действительно нужно положение окна:
eval $(xdotool getmouselocation --shell); echo $X $Y
Для получения дополнительных действий / опций проверьте справочную страницу.