невозможно размонтировать раздел truecrypt после доступа к нему через samba

Я не думаю, что вы хотите это сделать. Контроль источника - это просто контроль источника. Большинство из них не обрабатывают двоичные файлы (например, изображения, музыку, фильмы и т. Д.).

Кроме того, SCM предоставит вам строку по строкам, данные которой изменились. Поэтому каждый раз, когда вы входите в систему или выходите из системы, вы будете менять некоторые данные. Вам придется «объединять» или «совершать» все время. Я почти уверен, что это не то, что вы хотите.

Однако есть пара действительно хороших инструментов.

Back-In-Time - это потрясающе и имеет средство просмотра различий. Deja Dupe является дефолтом, но я не думаю, что он очень богат. grsync может предоставить вам список файлов с измененной резервной копией. и простой старый rsync - это вариант.

Если вы настаиваете на использовании SCM, я рекомендую git, но размещаюсь локально. Добавьте .gitignore, который исключает все двоичные файлы. Еще лучше, вы можете попробовать просто управлять вашими конфигурационными каталогами. И снова вам придется следить за двоичными файлами.